发现宝藏：“马德雷山脉的宝藏”的故事

1936年，美国考古学家印第安纳·琼斯在暗藏杀机的秘鲁神庙找到金像，但遭竞争对头雷内·贝洛克埋伏，金像被盗，琼斯乘待命的水上飞机逃走。回美国后他从陆军情报部获悉，纳粹德国势力在埃及塔尼斯附近大肆发掘，所发电报还提到琼斯的导师艾伯纳·拉文伍德。琼斯推断德国人在找约柜，德国元首阿道夫·希特勒深信其中蕴藏不可思议的神通，能令德军所向披靡。琼斯接受陆军情报部委托，决定抢在德国人之前找到约柜。
琼斯在尼泊尔的酒吧遇到旧情人、拉文伍德之女玛丽昂，得知先师已驾鹤西去。盖世太保阿诺德·托赫特赶来抢夺玛丽昂的奖章信物，酒吧在混战中起火，滚烫的奖章在托赫特手上留下烙印，琼斯与玛丽昂带着奖章逃脱并赶赴开罗。
两人从琼斯的朋友萨拉赫口中得知，贝洛克与德国同流合污，他们已经利用托赫特手上烙印制出不完整的奖章。纳粹党军人和雇佣兵来袭，玛丽昂似乎也在混乱中遇害，琼斯非常难过。伊玛目为琼斯解密奖章内容，一面警告不要打扰约柜，另一面是古埃及太阳神手杖的规格，利用手杖可以找到约柜。琼斯和萨拉赫看出德国人发掘的位置不对并潜入发掘现场，利用奖章和正确手杖定位灵魂之井，从中找到装饰精美的金色箱子——约柜。贝洛克和纳粹党人发现琼斯等人，原来玛丽昂没死但遭贝洛克俘虏。德国人抢走约柜并把琼斯和玛丽昂关入灵魂之井，两人找到出口并乘装载约柜的卡车逃走，随后把约柜装上汽船运往伦敦。
德国海军U型潜艇拦截汽船，劫走约柜和玛丽昂，琼斯偷偷进入潜艇。潜艇抵达爱琴海岛屿，贝洛克想在向德国元首献礼前测试约柜的神力。琼斯在途中伏击纳粹党团伙，威胁摧毁约柜。贝洛克毫不紧张，坚信琼斯绝不可能毁掉历史价值如此重大的物件，而且肯定也想知道约柜是不是真有那么神，琼斯最后放弃。德国人在测试现场把琼斯和玛丽昂绑住，贝洛克以庄重仪式打开约柜，但里面只有沙子。玛丽昂遵照琼斯的指示一起闭上眼，不看打开的约柜，里面飞出鬼魂、火焰，同时爆发极其强大的能量，现场包括贝洛克、托赫特在内的其他人全部死亡，约柜随即关闭。琼斯与玛丽昂睁开眼睛，发现德国团队的尸体不知所踪，捆绑两人的绳索不翼而飞。镜头转至华盛顿哥伦比亚特区，美国政府向琼斯和马库斯·布罗迪颁奖致谢，但拒绝琼斯的研究要求，声称约柜放在秘密地点，只有“高层人员”才能研究。最终约柜被装箱后运入有成千上万相似木箱的大仓库中封存，藏木于林，从此不知所踪。